為什麼有時候根管治療需要用顯微鏡操作？由於根管內的複雜性，肉眼條件下進行根管清理非常困難；手術顯微鏡可以使術者直接瞭解其細微結構，更為有效地清理根管，同時可以在根管充填前瞭解根管的乾燥程度和根管封閉劑在根管壁上的分佈情況。
手術顯微鏡可應用於所有牙髓根尖周病治療過程中，其中在尋找根管口、鈣化根管的疏通、根管治療的再治療、根管治療意外的預防和處理等方面具有不可替代的優勢。